Pues no me había parado a pensarlo.
Pues es muy fácil: inteligible viene del latín "intellegibilis", del verbo "intelligo", comprender. Una cosa que se entiende es inteligible. Como el prefijo "in" tiene como uno de sus usos "lo contrario", entonces ininteligible es que no se entiende.
Sencillo :]
Cisne Negro
http://cisne.blogspot.com
Es verdad, Gran Paco, igual que alguien con capacidad intelectual (in-telectual) es alguien inteligente (in-teligente. Con lo cual, los tontos son telectuales y teligentes.